Limit je 65536 souborů. Nicméně, proč ho nedat do jiného adresáře?
Nepíšeš, co máš za operační systém - ale předpokládám, že windows xp nebo něco novějšího - v tom případě není objektivní důvod na tom disku vůbec FAT32 mít. Krom jiných výhod, jako eliminace podobných omezení ti konverze na NTFS přinese i podstatné zvýšení rychlosti při přístupu do adresářu se spoustou soborů.
Převeést filesystém z FAT32 na NTFS můžeš udělat i bez nutnosti reinstalace systému - příkazem convert .
